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为什么只有甘氨酸没有光学异构体

为什么只有甘氨酸没有光学异构体

从α碳的取代基和手性中心的条件出发,解释为什么只有甘氨酸没有光学异构体。同时进行与丙氨酸的比较。

生物化学立体化学氨基酸
目录

在构成蛋白质的20种标准氨基酸中,甘氨酸是特殊的存在。大多数氨基酸具有手性中心,需要考虑D型和L型等立体异构体。然而,只有甘氨酸没有光学异构体。原因在于甘氨酸的侧链是氢原子


α碳的取代基:甘氨酸与其他氨基酸

一般α-氨基酸的结构可以表示为:

H2N-CH(R)-COOH

大多数氨基酸的α碳与氨基羧基氢原子R基这4种不同取代基结合。这样的碳成为手性中心,具有对映异构体

然而,甘氨酸的R基是氢。因此,与α碳结合的取代基为氨基、羧基、氢、氢。由于有两个氢,4种取代基并不全部不同

PubChem 描述甘氨酸为侧链是氢原子的最简单蛋白质构成氨基酸,是唯一的非手性蛋白质构成氨基酸。NCBI Bookshelf 也解释说,20种蛋白质构成氨基酸都是L异构体,除甘氨酸外α碳都有手性中心。


甘氨酸与丙氨酸的比较

氨基酸 α碳的取代基 手性中心 光学异构体
丙氨酸(例) NH2COOHHCH3 存在D型·L型
甘氨酸 NH2COOHHH 不存在
丙氨酸 甘氨酸
丙氨酸的结构式
丙氨酸的结构式
甘氨酸的结构式
甘氨酸的结构式

手性中心与光学异构体

没有手性中心意味着甘氨酸没有D型和L型的区别。对于丙氨酸和缬氨酸等氨基酸,可以区分互为镜像的两种构型,但甘氨酸的α碳周围有两个相同的取代基,因此镜像可以与原来的结构重叠。这就是甘氨酸没有光学异构体的原因。


从结构式确认

通过结构式确认这一区别会更容易理解。

  • 丙氨酸:α碳与 NH2COOHHCH3 结合 → 4个全部不同 → 手性
  • 甘氨酸:α碳与 NH2COOHHH 结合 → 有两个氢 → 没有手性中心

也就是说,甘氨酸的特殊性从结构式就能立刻理解


对蛋白质结构的影响

甘氨酸的小体积也影响蛋白质结构。由于侧链只有氢,甘氨酸比其他氨基酸空间位阻更小,容易出现在蛋白质主链可以相对自由运动的位置。NCBI Bookshelf 的 Molecular Biology of the Cell 解释说,蛋白质的三维结构由氨基酸序列决定,侧链间的相互作用稳定了折叠结构。甘氨酸的小侧链在这样的立体结构中具有独特的作用。

此外,甘氨酸是最简单的氨基酸,因此也适合作为学习氨基酸基本结构的第一个例子。但在解释手性时,必须作为例外来处理。重要的是理解大多数氨基酸是手性的,而甘氨酸是特殊的。


手性中心的成立条件

理解甘氨酸也能自然地理解手性中心的条件

  1. 碳有4个键(必要但不充分
  2. 4个取代基全部不同这是必要条件

甘氨酸不满足条件2,因此不能成为手性中心。单纯地拥有4个键的碳并不足够。结合的取代基必须全部不同


总结

甘氨酸没有光学异构体的原因是侧链是氢原子,α碳上结合了两个相同的氢。因此,α碳没有4种不同的取代基不能成为手性中心。甘氨酸是蛋白质构成氨基酸中最简单的,是唯一的非手性氨基酸