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什么是氨基酸?从结构式看基本结构

什么是氨基酸?从结构式看基本结构

从氨基、羧基、α 碳、R 基这四个要素来梳理氨基酸的基本结构。是从结构式解读性质的入门指南。

生物化学氨基酸
目录

氨基酸是构成蛋白质的基本单位。在生物体内,蛋白质被分解后会变成氨基酸,这些氨基酸又会被用于蛋白质的合成、体组织的修复以及代谢等过程。MedlinePlus 解释说,氨基酸和蛋白质是生命的基本构成要素,身体使用氨基酸来制造蛋白质。

从化学结构的角度来看,氨基酸正如其名,是同时含有氨基羧基的化合物。一般的氨基酸具有这样一种形式:以一个中心碳原子为中心,连接着氨基、羧基、氢原子和侧链。这个侧链也被称为 R 基,每种氨基酸的 R 基都不相同。NCBI Bookshelf 解释说,构成蛋白质的氨基酸具有 α-羧基、α-氨基和 R 基,R 基的不同决定了每种氨基酸的性质。


基本的化学结构

氨基酸的基本结构可以用如下结构式来表示。

H2N-CH(R)-COOH

该式中各部分的含义如下。

符号 名称
CH α 碳
NH2 氨基
COOH 羧基
R 侧链(每种氨基酸不同)

R 基的不同决定了氨基酸的种类。R 基为氢时是甘氨酸,为甲基时是丙氨酸,为苄基时是苯丙氨酸。也就是说,即使氨基酸的公共部分相同,只要 R 基不同,就会成为另一种氨基酸

氨基酸 R 基
甘氨酸
丙氨酸 甲基
苯丙氨酸 苄基
甘氨酸 丙氨酸 苯丙氨酸
甘氨酸的结构式
甘氨酸的结构式
丙氨酸的结构式
丙氨酸的结构式
苯丙氨酸的结构式
苯丙氨酸的结构式

侧链(R 基)决定性质

通过结构式来理解氨基酸时,重要的不是简单地记住"它是蛋白质的原料"。氨基偏碱性羧基偏酸性,而侧链决定了疏水性、亲水性、酸性、碱性、芳香性等。因此,通过观察氨基酸的结构,就可以推测该氨基酸是否容易溶于水、是否容易处于蛋白质内部、是否容易带电荷。

例如,甘氨酸的侧链只有一个氢,是最小的氨基酸。PubChem 也将甘氨酸描述为最简单的蛋白质组成氨基酸,其侧链为氢原子,并且是唯一的非手性蛋白质组成氨基酸。另一方面,像赖氨酸精氨酸这样具有碱性侧链的氨基酸,在生理条件下容易带正电荷,参与蛋白质表面以及与其他分子之间的相互作用。


从结构理解的 4 个要素

学习氨基酸时,与其一开始就死记 20 种氨基酸的名字,不如先理解它们的共同骨架。一旦能够在结构式中找出以下四个要素,就可以从结构式入手来对各种氨基酸进行分类。

  • 氨基-NH2
  • 羧基-COOH
  • α 碳(中心碳)
  • R 基(侧链)

总结

氨基酸是同时具有氨基羧基的有机化合物。在构成蛋白质的氨基酸中,α 碳上连接着氨基、羧基、氢原子和 R 基。各种氨基酸之间的差别主要由 R 基决定,这一差别也会反映在蛋白质的性质和功能上。